在税收征管实际工作中，由于各种原因会产生错误的信息（如申报信息、稽查案件等），这些错误信息在税收会计进行帐务处理后是不能进行作废处理的。为此需要将已作帐务处理的记录进行回退，将相关的帐务（记帐凭证、科目汇总表、科目月结、年终结转、当前科目余额）数据删除，并将各原始凭证数据的记帐标志置为未入帐。

税收会计岗人员在完成入库销号、记帐凭证生成、月结等工作后，在CTAIS中按：征收监控—税收会计—报表的顺序进入本模块，选定所需生成的会计报表种类并双击，录入正确的时间区间后点击“生成新报表”，系统自动完成报表的生成处理。

对于汇算清缴中核实的多缴所得税税金在CTAIS系统应通过“企业所得税汇算清缴”、“外资企业所得税汇算清缴”模块形成应退来源。前提是该企业必须进行了年度所得税申报。在CTAIS中按：征收监控—纳税申报—申报—企业所得税汇算清缴或外资企业所得税汇算清缴进入功能模块，录入税务机关核实的数据后保存，系统按纳税人申报的应补退税金和税务机关核实的应补退税金差额形成应退税金。

通过增值税申报与增值税发票数据比对清册查询模块进行验证查询。在CTAIS中按：业务主窗口—申报征收—查询统计—申报查询—增值税申报与增值税发票数据比对清册查询的顺序进入查询界面。

当分支机构在外地预缴、总机构抵缴的，以总机构税务机关征收部门负责人的用户登录，在CTAIS中按：征收监控—征收核算—数据维护—期初预缴设置>的顺序进入预缴设置模块，以总机构纳税人名义输入各分支机构已预缴税额信息。在总机构纳税申报时，系统将自动提取已设置预缴信息，抵缴总机构申报税额。

在CTAIS中按：申报征收—征收—核销欠税的顺序进入本功能模块，输入纳税人识别号（如果没有欠税系统会提示），选入征收项目，系统提取欠税，在“核销税款”项中输入核销数据，单击“保存”按钮即可。选中按“查询欠税”按钮，系统提示欠税或呆账信息，选中后按“保存”按钮，完成税款核销。如果在未记账前想回退核销操作，单击“查询已处理税款”按钮，弹出处理的核销查询窗口，选中数据行单击“作废”按钮，完成回退操作。单击“退出”按钮，退回核销界面。已开票的欠税必须先作废税票后才能核销。

重点税源认定期限的设置是进行重点税源认定的前提。在CTAIS中按：征收监控—税收计划—重点税源—重点税源认定期限设置的顺序进入本功能模块，点击“增加”按钮，对认定年度、认定税务机关、认定期限起止进行设置并保存。

本期预缴数为纳税人缴款的预缴税款，但不包含查补预收税款。

会统报表上的行业统计数据与征收品目统计数据不匹配时，应在系统中的“行业明细与征收品目对照关系维护”中进行处理。按“申报征收—数据维护—行业明细与征收品目对照关系维护”的顺序进入本功能模块，对行业明细与征收品目对应关系进行维护，删除错误的对应关系，增加正确的对应关系。此模块维护的对应关系，将在原始凭证产生环节（申报征收等）作为数据合理性校验依据，较大程度避免不合理数据的出现。

由于采用月结处理一个月只能进行一次，存在一定局限性，例如想随时查询所有会计科目的余额、随时进行科目的试算平衡，这种要求就不能满足。为了解决这种不足，增加了“当前科目余额”模块，通过本模块可以结算到目前为止所有会计科目的累计余额。